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天氣變化、極端天氣事件以及氣象災害等對呼吸道傳染病、腸道傳染病，以及各種自然疫源性具有影響，氣候和環境的變化還對某些新傳染病的產生和某些傳染病消亡具有影響等，流行病學專家也很關注氣象災害與人類健康之間的關系，氣象災害對人類健康造成最直接的危害是引起傷亡，間接危害是導致生態環境的改變，自然疫源地的遷徙、擴大，從而引起各種傳染病的暴發流行。
洪澇災害時易發生的傳染病主要有消化道傳染病(霍亂、甲肝、戊肝、痢疾、傷寒、感染性腹瀉、腸炎等)，呼吸道傳染病(流腦、麻疹、流感、感冒等)，自然疫源性(鼠疫、血吸蟲病、鉤體病、出血熱等)，蟲媒傳染病(乙腦、等)，(濕疹、皮膚真菌感染等)，紅眼病等。

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