企業申請食品經營許可證需要準備以下申請材料：

食品經營許可申請書：企業需在食品經營許可申請書上詳細填寫申請許可的經營項目、經營場所、倉庫地址、主要負責人、經營規模等信息，并加蓋公章或簽字。

營業執照或者其他主體資格證明文件復印件：企業需提供營業執照或其他主體資格證明文件復印件，以證明其具備經營該類食品的資質。

與食品經營相適應的主要設備設施布局、操作流程等文件：企業需提供與食品經營相適應的主要設備設施布局、操作流程等文件，包括主要設備設施布局圖等，以證明其具備符合要求的生產經營條件。

食品安全自查、從業人員健康管理、進貨查驗記錄、食品安全事故處置等保證食品安全的規章制度：企業需提供食品安全自查、從業人員健康管理、進貨查驗記錄、食品安全事故處置等保證食品安全的規章制度，以證明其有能力保證食品安全。

食品安全管理員制度：企業需提供食品安全管理員制度，明確食品安全管理員的職責和工作制度，以證明其有能力保證食品安全。

《授權委托書》及被委托人身份證明復印件：如果企業委托代理人提出許可申請時提交，需要提供《授權委托書》及被委托人身份證明復印件。

其他相關材料：根據當地食品藥品監督管理局的要求，企業還需提供其他相關材料，如食品安全培訓計劃、食品安全管理規章制度等。

需要注意的是，不同地區的食品藥品監督管理局對申請材料的具體要求可能有所不同，企業需按照當地要求準備申請材料。企業應當保證所提供的申請材料真實有效，并承擔相應的法律責任。