一、企業申報的領域問題

企業填報申報高新技術企業系統時技術領域選擇錯誤。

二、核心自主知識產權問題

專利為實用新型或外觀設計專利，未發揮核心支持作用的專利，技術含金量不高，無法取得高分甚至會不得分；

專利取得為外購或者權利轉讓，部分企業不經過消化吸收直接應用生產，缺乏研發過程。

三、企業人員問題

科技人員工作時間難確定：企業聯合外地科研單位外聘科研人員時，難以判斷外聘人員能否符合到崗183天的時間要求；

四、高新技術收入占比問題

產品的證明材料不足，檢測報告不能支撐產品的技術性、創新性，不能被專家認可，剔除后導致高新收入占比不夠。

五、主要產品收入不足高新產品收入的50%

企業知識產權數量有限，高新產品收入歸集存在問題等原因，造成主要產品收入不足高新技術產品收入的50%，不符合必要的申報條件；

六、研究開發管理制度文件千篇一律

不能根據企業的實際情況制定制度文件，全部為網上模板，實際得分1-2分，極大降低高新技術企業評分總分。

七、缺少重要證明材料

有的企業提供的是增值稅納稅申報表，有的提供的是企業所得稅季報申報表；

因壓縮技術不佳，上傳資料存在缺漏。

八、財務存在問題

年度審計報告中注冊會計師出具審計意見為“保留意見”；

企業自行修改納稅申報表，存在作假問題。

九、產品銷售與發票開具問題

發票不開具高新產品名稱，銷售收入歸集難：高新技術產品銷售開票項目只寫統稱，僅在規格欄中注明代碼，發票對應銷售收入難以鑒別是否屬于高新產品；

十、研發費用核算歸集問題

研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例符合如下要求：

*近一年銷售收入小于5,000萬元（含）的企業，比例不低于5%；

*近一年銷售收入在5,000萬元至2億元（含）的企業，比例不低于4%；

*近一年銷售收入在2億元以上的企業，比例不低于3%。