北京亦莊學校工廠園區排水排污許可證辦理過程中的疑難問題可能包括：

申請材料不齊全或不符合要求：在辦理排水排污許可證的過程中，需要提交一系列的申請材料，如企業基本情況、排污情況、排污許可證申請表、環境影響評價報告等。如果申請材料不齊全或不符合要求，可能會導致申請被駁回或延誤審批。

現場檢查不合格：在提交申請材料后，通常需要進行現場檢查以確認企業的排污情況和環保設施的運營狀況。如果現場檢查不合格，可能需要重新整改，甚至會被拒絕頒發許可證。

對許可條件和審批流程不夠了解：排水排污許可證的許可條件和審批流程可能比較復雜，如果對相關規定和要求不夠了解，可能會導致申請過程中出現錯誤或延誤。

缺乏的代辦服務：由于排水排污許可證的申請需要的代辦服務，如果缺乏的代辦服務，可能會導致申請過程中出現不必要的麻煩和延誤。

為了解決這些疑難問題，可以尋求的代辦機構的幫助。代辦機構可以提供全面的咨詢和代理服務，幫助您順利獲得許可證，快速解決問題。代辦機構的團隊將為您提供全方位的支持和幫助，包括申請材料的準備、現場檢查的協調等，確保您的許可證辦理過程順利進行。

如果您需要代辦服務，可以咨詢相關的代辦機構或人士獲取具體信息和服務