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蛋白質從頭測序鑒定流程和特點

品牌名稱: 百泰派克生物科技
業務范圍: 技術服務
經營模式: 生產廠商
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所在地: 河北 保定
有效期至: 長期有效
發布時間: 2023-12-21 04:35
最后更新: 2023-12-21 04:35
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關鍵詞:蛋白質從頭測序流程,蛋白質從頭測序,蛋白質組學,代謝組學,tmt,抗體測序,itraq,蛋白質譜鑒定,蛋白質組學,代謝組學,tmt,抗體測序,itraq,蛋白質譜鑒定

蛋白質分子的序列是蛋白質發揮功能的基礎。準確測定蛋白質序列在在研究蛋白功能表位,檢測商業單克隆抗體,疫苗,以及試劑盒等藥物方面有著很重要的作用。目前已有很多對蛋白測序的研究,目前對蛋白質精準測序還是不能夠像DNA一樣快速精準。蛋白測序主要受制于蛋白樣品純化,構成蛋白的氨基酸組成種類眾多等復雜因素影響。

這期給大家科普的技術叫做蛋白質從頭測序(De novo se),又叫全新蛋白測序,這項技術是根據肽段與惰性氣體相碰撞產生的一系列的有規律的片段離子之間的質量差來推斷氨基酸序列。我們可以根據肽鍵斷裂處的y離子和b離子來推測氨基酸序列,以及翻譯后修飾。De novo se有一項突出的優勢,是傳統質譜測序不能達到的,那就是不依賴任何蛋白質數據庫,對未知蛋白質從頭測序。

在傳統測序中,往往只能檢測蛋白消化后的部分肽段序列,再用這些肽段序列與已知的蛋白數據庫進行比對,根據一定算法打分,推算出可能性高的蛋白和序列。

傳統的測序的局限有:

1-. 質譜測序依賴于公共數據庫。 如果所研究的物種的基因組沒有完全被測序,或者其中部分沒有對應的序列, 那么質譜測序將無法得出正確的鑒定。

2. 使用的搜索引擎的打分和算法可能也會遺漏一部分的肽段和質譜圖的匹配, 產生假陽性結果。

3. 如果有點突變或者未知修飾存在的話, 由于搜庫算法或者參數設置中沒有考慮到, 同樣也無法得出正確的結果。

這些傳統質譜測序的局限都可能在De novo se中被突破,選用De novo se可以提供傳統測序至今無法準確評估的服務,包括:蛋白質突變分析、全新蛋白/肽段從頭測序、單克隆抗體從頭測序等。

De novo se鑒定流程和具體特點

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蛋白質從頭測序分析流程

服務項目

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從頭測序分析服務項目

服務優勢

? 采用高精準度質譜儀Obitrap Fusion Lumos

? 全長測序覆蓋率高達1_0_0_%

? 首位氨基酸測序準確率高達95%

? 樣品用量低:蛋白樣品僅需100ug,即可完成檢測


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北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(包括蛋白質、多肽、代謝物)質譜分析以及小分子物質檢測服務。公司采用ISO9001質量控制體系,專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務,業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等。7大質量控制檢測平臺,服務3000+企業,10000+客戶的選擇,致力于為您提供y_ō_u|z_h_ì的生物質譜分析服務!


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