果醋一般采用水果經發酵工藝而釀造，分為全果發酵、果汁液態發酵等方式，過濾設備的選擇搭配均不相同，但果醋的澄清過濾大體分為以下幾步：

第一步、除大顆粒或泥狀果肉殘渣，實現果醋發酵液的初步固液分離；

第二步、初分的濾液中仍然含有部分細小懸浮物、微粒子，需微濾；

第三步、微濾液在采用精濾或膜超濾設備，實現果醋的澄清過濾。

傳統第一步過濾多選擇板框粗濾進行固液分離，板框一次性投入低，但操作繁瑣，濾布等耗材更換量大，且除雜效果對于某些高固含量的果醋全果發酵液分離不夠理想。板框后接濾芯或硅藻土等過濾，一次性投入本都雖低，濾芯耗材量大，按照產能綜合算下來，投入也不算低，硅藻土由于孔徑分布不均勻，對果醋中的香氣、有效組分進行吸附，對果酒口感影響較大，且容易掉土，污染產品。部分經過硅藻土過濾后果醋只能臨時性的澄清，在溫度及電荷的影響下，未除去的大分子雜質會團聚析出，即返渾沉淀，導致產品貨架期短，嚴重影響市場銷售。

對于產能較小、物料性狀較好的物料，選擇板框、自然沉降、濾芯等處理也具有很好的優勢，但這些只能作為前處理過濾，為保證過濾的穩定性及較長的貨架期，需采用先進膜分離超濾技術，即果醋澄清膜過濾系統在分子級對果醋中溶解性的果膠、雜蛋白、酵母自溶物等進行高精度過濾，有效透過果醋營養組分的截留除去上述大分子雜質。膜超濾設備一次性投入成本較傳統過濾設備投入高，但若操作維護到位，按照產能、人工投入等綜合評估，投入成本與傳統過濾設備投入也相差不大。

典型應用：桑葚醋、蘋果醋、柿子醋、刺梨醋、山楂醋、棗醋、木瓜醋、藍莓醋、蒜醋等果汁類發酵醋。