三類醫療器械經營許可證辦理指南如下:一、辦理三類醫療器械許可證的流程:1、申請人提交申請資料到相關部門;2、相關部門受理申請人的申請;3、到實際場地進行勘察以及對產品進行審核;4、準予頒發三類醫療器械許可證。